利用功能基因单倍型网络研究水稻盐旱共响应
干旱和盐害是制约水稻产量的重要非生物胁迫,相关功能基因的研究始终是领域内的热点。然而,由于抗逆性状的复杂性及影响因素的多样性,针对盐旱共响应的多胁迫作用机制仍不明确,如何有效利用抗逆功能基因组学的研究成果进行设计育种,也是后基因组时代水稻育种的关键问题。近日,安徽农业大学农学院在中科院生物类Top期刊(IF=5.)InternationalJournalofMolecularSciences(IJMS)发表题为“CandidateGenesandPathwaysinRiceCo-RespondingtoDroughtandSaltIdentifiedbygcHapNetwork”的研究性综述论文。在系统介绍水稻盐旱机制的同时,结合转录组分析筛选到个盐旱共响应基因,主要富集在植物激素信号传导、内质网蛋白调控,MAPK等重要通路,进而对其中的核心基因进行功能单倍型网络分析,构建了“gcHap-networkpathway”的盐旱共响应机制框架图。同时整理了近份耐盐抗旱水稻品种,分析发现在重要亲本中大多包含上述核心基因及有利单倍型,为将来进一步进行系统验证和分子设计育种提供了重要参考。安徽农业大学农学院20级硕士研究生郝芷圻、马赛为论文的共同第一作者,中国农业科学院深圳农业基因组研究所孟丽君副研究员,安徽农业大学农学院黎珉副教授为共同通讯作者,多名硕士生参与了此项工作。该研究得到了国家自然科学基金联合基金、国家自然科学基金、安徽省重点研发项目的资助。论文链接:
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